Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPI1P17947 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPI1P17947 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPI1P17947 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPI1P17947 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPI1P17947 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms