Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CTLA4P16410 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CTLA4P16410 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTLA4P16410 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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