Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSP16219 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSP16219 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSP16219 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSP16219 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSP16219 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms