Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCKDHAP12694 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHAP12694 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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