Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms