Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms