Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf88P0DMB2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms