Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F13BP05160 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13BP05160 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13BP05160 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13BP05160 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13BP05160 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
F13BP05160 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13BP05160 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13BP05160 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13BP05160 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13BP05160 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13BP05160 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13BP05160 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13BP05160 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13BP05160 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13BP05160 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms