Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P02748 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P02748 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P02748 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9P02748 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9P02748 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms