Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms