Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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CLDN9O95484 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN9O95484 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
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CLDN9O95484 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLDN9O95484 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLDN9O95484 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLDN9O95484 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLDN9O95484 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLDN9O95484 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLDN9O95484 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLDN9O95484 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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