Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms