Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIN3BO75182 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms