Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSVO60911 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSVO60911 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSVO60911 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSVO60911 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSVO60911 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSVO60911 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSVO60911 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSVO60911 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSVO60911 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSVO60911 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms