Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPAN2O60636 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPAN2O60636 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms