Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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