Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA5O15230 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA5O15230 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA5O15230 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA5O15230 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA5O15230 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA5O15230 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA5O15230 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA5O15230 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA5O15230 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA5O15230 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms