Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TO15178 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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