Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRTO14522 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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