Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms