Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F3O00716 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms