Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMX2-CTNND1H3BSU7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms