Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF879B4DU55 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms