Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms