Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8B2A6NJW9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms