Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L9A6NEM1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms