Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms