Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4BQ9Y4P1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms