Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms