Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED16Q9Y2X0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED16Q9Y2X0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms