Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms