Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF6Q9Y252 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF6Q9Y252 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF6Q9Y252 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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