Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIPT1Q9Y234 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIPT1Q9Y234 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIPT1Q9Y234 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 327.4 ms