Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMKLBQ9ULI2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms