Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MKLN1Q9UL63 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms