Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT172Q9UG01 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT172Q9UG01 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms