Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CGGBP1Q9UFW8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms