Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms