Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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