Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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