Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNK4Q9NYG8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNK4Q9NYG8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms