Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC10Q9NYD6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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