Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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