Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THUMPD1Q9NXG2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms