Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EMILIN3Q9NT22 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms