Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSHZ2Q9NRE2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSHZ2Q9NRE2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms