Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms