Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms