Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FANCFQ9NPI8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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FANCFQ9NPI8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FANCFQ9NPI8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FANCFQ9NPI8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FANCFQ9NPI8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FANCFQ9NPI8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FANCFQ9NPI8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FANCFQ9NPI8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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