Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms